南京航空航天大学航空工程实验教学中心是国家级实验中心。承担着学校十二个本科专业的实验教学和全校大学生课外科技创新相关实验与研发任务，既是实验教学平台，又是学生创新实践锻炼场所。中心由七个专业性实验室和六个大学生创新实验室构成。中心现有教师93名，形成了一支教师与实验技术人员结合、专职与兼职结合、教学与科研结合的实验教学师资队伍。中心面积近17000平方米，实验设备台套数约300件，仪器总价值16000万元。中心实行主任负责制，实验教学任务由中心统一安排分配到各实验室，同时各实验室对学生开放，学生可自主选择计划外的实验项目。中心依托国家重点学科和特色专业，以飞行器设计、制造和控制实验系统为主线，以培养学生实践能力、创新能力、综合能力和研究能力为目标，坚持学科交叉与学科综合，构造了以“四个层次”为基础、形式多样、系统化的实验教学体系。近五年来，中心共承担了国家级和省部级教改项目17项，获国家级教学成果4项、省部级教学成果10项，发表教学研究论文40多篇。承担国家级科研项目45项，省部级科研项目78项。共获得国家级科技成果7项，省部级科技成果30多项。学生共获得80多项国家级创新科技大奖赛奖和6次团队组织优胜奖，申请国家专利128项。连续四年获得省优秀毕业设计团队奖。3位学生获得“中国青少年科技创新奖”。